docker images的下载链接如附表所示,下载 bioinfo-coexp.tar.gz 启动新的docker.
docker load -i ~/Downloads/bioinfo-coexp.tar.gz # 请根据下载文件的实际位置调整输入内容mkdir ~/Downloads/datadocker run -dt --name coexpression --restart unless-stopped -v ~/Downloads/data:/data gangxu/coexpression:1.5
docker load -i Downloads\bioinfo-coexp.tar.gz # 请根据下载文件的实际位置调整输入内容mkdir ~/Downloads/datadocker run -dt --name coexpression --restart unless-stopped -v ~/Downloads/data:/data gangxu/coexpression:1.5
加载完我们提供的image后,文件都已经准备好了,可以这样查看:
docker exec -it coexpression bashcd /home/biocls
本教程docker使用方式:
1) 运行容器:
docker exec -it coexpression bash
2) 进行Linux系统的相关操作
3) 退出容器:
exit
docker load -i ~/Downloads/bioinfo_mirna_target.tar.gzdocker run -dt --name mirna --restart unless-stopped -v ~/Downloads/data:/data mirna_targets:1.0docker exec -it mirna bashcd /home/test/mirna
docker load -i ~/Downloads/bioinfo_rbp.tar.gzdocker run -dt --name rbp --restart unless-stopped -v ~/Downloads/data:/data gangxu/bioinfo_rbp:2.0docker exec -u root -it rbp bashcd /home/test/rbp
注意:4.2,4.3的docker安装均以Mac为例,Windows用户请按4.1案例将"docker load -i ~/..."改为"docker load -i ..."
如果不使用docker,也可以直接下载教程所需文件:Download Link