6.RNA Regulation Analyses

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方法1: 使用docker

6.1 RNA Editing 下载 bioinfo_rnaeditor.tar.gzdata2_part1.zip data2_part2.zip

启动新的docker.

docker load -i ~/Desktop/bioinfo_rnaeditor.tar.gz
# 解压数据 (或者双击解压)
unzip data2_part1.zip
unzip data2_part2.zip
#将文件夹中的data2文件合并。
mv data2_part1/data2/ /Users/xugang/Downloads/data2
mv data2_part2/dbSNP.vcf* /Users/xugang/Downloads/data2
#文件目录为/Users/xugang/Downloads/data2,启动时,挂载目录。
#自己运行时记得改为自己的目录地址。
docker run --name=rnaeditor -dt -h bioinfo_docker --restart unless-stopped -v /Users/xugang/Downloads/data2:/data2 gangxu/rnaeditor:1.5
docker exec -it rnaeditor bash
cd /home/test
  • 退出容器:exit

6.2 APA, 6.3 Ribo-seq, 6.4 Structure-seq 下载 bioinfo_tsinghua_6.2_apa_6.3_ribo_6.4_structure.tar.gz

启动新的docker.

docker load -i ~/Desktop/bioinfo_tsinghua_6.2_apa_6.3_ribo_6.4_structure.tar.gz
docker run --name=rnaregulation -dt -h bioinfo_docker --restart unless-stopped -v ~/Desktop/bioinfo_tsinghua_share:/home/test/share gangxu/bioinfo_tsinghua_6.2_apa_6.3_ribo_6.4_structure:latest
docker exec -it rnaregulation bash
cd /home/test/rna_regulation
  • 退出容器:exit

方法2: 直接下载

  • 如果不使用docker,也可以直接下载教程所需文件:Download Link