Appendix I. Keep Learning

在生物信息学的学习和应用中,最重要的、最有用的基本工具和技能,过去一直是,我相信将来的很长一段时间也会是:

  1. google

  2. wikipedia

  3. 知乎

⭐: 必读 ✨: 推荐

📖 1) Recommended Books

📖a. 参考书 - 综合

选择性阅读的案头书

📖 b. 参考书 - 工具书

按需阅读和练习

Better to learn and practice 3 basic techniques (完成任何一个要求即可:1. 1000行以上的程序; 2. 认可证书,例如在线课程的正式)

  1. R (or MATLAB)

  2. Python (or Perl)

  3. Linux (Editor (e.g. VIM) and Shell Script (e.g. bash))

  1. ⭐Quick R (online) OR 《R语言实战》 (《R in action》)

  2. ⭐《笨办法学 Python》(《Learn Python The Hard Way》)OR 《Beginning Perl for Bioinformatics》

Linux 推荐章节:

  • 第5章: 5.3.1 man page; 第6章: 6.1用户与用户组; 6.2 LINUX文件权限概念; 6.3 LINUX目录配置

  • 第7章: 7.1目录与路径; 7.2文件与目录管理; 7.3文件内容查阅; 7.5命令与文件的查询; 7.6权限与命令间的关系; 第8章: 8.2文件系统的简单操作

  • 第9章: 9.1压缩文件的用途与技术; 9.2 Linux系统常见的压缩命令; 9.3打包命令:tar

  • 第10章 vim程序编辑器

  • 第11章 认识与学习bash; 第12章 正则表达式与文件格式化处理;第13章 学习shell script

  • 第25章 LINUX备份策略: 25.2.2完整备份的差异备份; 25.3鸟哥的备份策略; 25.4灾难恢复的考虑; 25.5重点回顾

Linux 重点学习:

  1. Editor (e.g. VIM)

  2. Shell Script (e.g. bash)

📖 c. 参考书 - 统计类

📖 d. 参考书 - 进阶类

半年以上经验

🎓 2) Recommended on-line Courses

💡 3) Recommended Tips

🔍 4) Recommended Tools and Scripts